Présentation

 

 

Mission

La création de la Collection de l'Institut Pasteur (CIP) remonte au Dr Binot qui a commencé à conserver des souches dès 1891. La lyophilisation a débuté à la CIP vers les années 1950. Depuis plus d'un siècle maintenant, la CIP se trouve dans les mêmes locaux.

La Collection de l'Institut Pasteur a pour mission d'assurer la maintenance et l'enrichissement de la collection de bactéries, d'abord par le biais de collaborations avec les scientifiques de l'Institut Pasteur mais aussi par le dépôt de souches de chercheurs français et étrangers. La CIP assure la diffusion des informations concernant les souches distribuées (propriétés, conservation, identification...) et l'édition d'un catalogue. La CIP développe également une activité de recherche sur l'identification, la taxonomie, la conservation des souches et participe à différents enseignements.

Le prix de vente des souches ne reflète pas le prix de revient réel des souches, étant donné le nombre important de contrôles effectués sur chaque souche.

Généralités

Ce catalogue reflète le désir de l'Institut Pasteur de jouer un rôle actif dans tous les aspects des Sciences Microbiologiques. Parmi les objectifs attribués à la Collection de l'Institut Pasteur (CIP), se trouve celui de maintenir un contact étroit avec la recherche taxonomique. Une collection de plasmides a été mise en place pour tirer profit du potentiel existant à l'Institut Pasteur. Les innovations dans le contrôle des souches (galeries Biotype-100, ribotypie, chimiotaxonomie, profil de plasmides, séquençage du gène codant pour l'ARN16S) réhausse la valeur des souches de la CIP auprès de la communauté scientifique.

En 1992, la CIP a rejoint la WFCC (World Federation of Culture Collections) et est enregistrée sous le numéro 759 dans le WDCM (World Directory of Collection of Micro-organisms). En 1995, la CIP a été intégrée dans le réseau MINE (Microbial Information Network in Europe) et en 1996, la CIP a rejoint l'ECCO (European Culture Collection Organization).
La CIP fait également partie du réseau CABRI (Common Access to Biological Resources and Information) et de la WFCC (World Federation for Culture Collection).

La CIP est certifiée selon le référentiel ISO 9001, version 2000, par l'Association Française de l'Assurance Qualité (AFAQ). Ce système garantit un service de haute qualité dans l'acquisition, la production, la conservation et le contrôle des souches bactériennes, plasmides et suspensions de spores.

Assurance Qualité

En Juillet 2001, la CIP a été certifiée selon le référentiel ISO 9001, version 2000, par l'Association Française de l'Assurance Qualité (AFAQ).
La mise en place de cette démarche Qualité a permis de formaliser et d' améliorer les pratiques courantes et les documents concernant l'acquisition, la production, la conservation et le contrôle des souches bactériennes, plasmides et suspensions de spores distribués par la CIP. Cette démarche Qualité garantit la Qualité du service de la CIP qui vise à satisfaire pleinement ses clients.

L'ensemble des activités est formalisé par écrit au sein d'un système documentaire architecturé et adapté à l'organisation de la CIP. Les opérations sont enregistrées. Les dispositions mises en place sont en permanence appliquées et améliorées. Régulièrement, des audits internes sont réalisés afin d'évaluer les éventuels écarts entre "ce qui est fait et ce qui est écrit".

Des indices Qualité sont établis à partir des incidents de laboratoire relevés et des réclamations des clients. Régulièrement, le correspondant Qualité effectue un bilan. Des actions correctives et préventives sont déclenchées si necessaire. Une revue de Direction annuelle permet de faire le bilan de l'année écoulée et de définir les objectifs de l'année suivante.

Toutes les souches expédiées sont contrôlées selon un plan de contrôle défini. La conformité est établie par rapport aux spécifications établies. La CIP assure la qualité des souches jusqu'à leur expédition. Par conséquent, la CIP est dégagée de toute responsabilité au-delà de ce stade.

La CIP prend en compte toute réclamation effectuée dans un délai de 8 jours pour les souches repiquées et dans un délai de 3 mois pour les souches lyophilisées, à partir de la date d'expédition.

Conservation des souches

La plupart des souches sont conservées par lyophilisation. La CIP utilise également la cryoconservation par stockage à - 80°C ou à -196°C.

Les souches sont conservées selon deux méthodes différentes, dans deux endroits différents.

Mise en culture des souches lyophilisées

Les souches lyophilisées sont fournies dans des ampoules ou des flacons sous vide. Les ampoules peuvent être ouvertes dans un laboratoire de Microbiologie classique (excepté pour les souches de groupe de pathogénicité 3) comme indiqué ci-dessous.
Vous pouvez également consulter les deux vidéos suivantes :
video1 (2184 Koctets) et video2 (3284 Koctets)
Pour visualiser ces vidéos vous avez besoin du logiciel QuickTime disponible ici.
Vous pouvez aussi télécharger ces vidéos sur votre ordinateur en faisant clic droit sur le lien et "Enregistrer la cible sous".

		Incuber dans les conditions spécifiées de température et d'atmosphère.

Incuber dans les conditions spécifiées de température et d'atmosphère.

Remarque : un deuxième repiquage est nécessaire avant toute utilisation de la souche.

Description des souches

Les souches sont décrites sous leur nom le plus récent. Les noms utilisés sont répertoriés dans la liste des 'noms approuvés' (Skerman et al., 1980) ou ont été publiés après 1980 dans l'International Journal of Systematic Bacteriology (Int. J. Syst. Bacteriol.) et après 2000 dans l'International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (Int. J. Syst. Evol. Microbiol.)

La description de chaque souche bactérienne inclut les informations suivantes :

Lorsque la souche n'a pas encore été validée ou publiée dans Int. J. Syst. Evol. Microbiol., le nom scientifique de la souche est placé entre guillemets.
Exemple : "Haemophilus agni" Kennedy et al."

Elle correspond à l'année de validation de l'espèce.

Il correspond à la dernière dénomination avant le changement de nomenclature. Pour de plus amples renseignements concernant les changements de nomenclature, consulter les sites de JF Euzeby, et DSMZ : nomenclature bactérienne.

Il reprend la liste publiée dans le Journal Officiel des Communautés Européennes, Directive 2000/54/CE du Parlement Européen et du Conseil du 18 septembre 2000.

La lettre "T" qui suit le numéro CIP indique qu'il s'agit de la souche type.
Les demandes de souches marquées 'X' et 'XX' nécessitent des conditions spéciales d'expédition.

Distribution des souches

La distribution des souches est limitée aux établissements publics, privés et d'enseignement disposant d'un laboratoire de bactériologie. Toute demande doit être adressée par écrit (courrier ou fax) sur le papier à en tête de l'établissement en indiquant le nom et l'adresse du demandeur. Une fiche de renseignement clients est à remplir lors de la première commande. Les tarifs des produits disponibles et des services proposés par la CIP sont sur le site. Ils peuvent être également obtenus auprès de notre secrétariat ou par courrier électronique à l'adresse suivante : cip@pasteur.fr.
Pour certaines souches, la commande doit être accompagnée d'une décharge de responsabilité:
Pour les souches marquées x : décharge de responsabilité D
Pour les souches marquées xx : décharge de responsabilité X

Etablissement d'enseignement
En ce qui concerne les souches figurant sur la liste réservée aux établissements d'enseignement (Journal Officiel du 6/11/1973), aucune décharge de responsabilité n'est exigée pour les établissements d'enseignement.
Aucune souche de groupe de pathogénicité 3 n'est délivrée aux établissements d'enseignement.

Laboratoire de l'Institut pasteur
Tout laboratoire de l'Institut Pasteur désirant obtenir des souches de la CIP doit remplir le formulaire de demande de souches par les laboratoires de l'Institut Pasteur.

Souches protégées
La distribution de certaines souches protégées nécessite un materiel transfert agreement (MTA).

Cliquez sur ce lien pour tout renseignement complémentaire concernant la réglementation des transports de matières infectieuses.

Dépôt des souches bactériennes à la CIP

La CIP est très reconnaissante vis-à-vis des scientifiques qui déposent leurs souches à la CIP et les en remercie vivement.

Le dépôt d'une souche s'accompagne du formulaire de dépôt de souches dûment rempli en indiquant les conditions de culture, les composants du milieu de culture si nécessaire et la bibliographie.

Dépôt en vue d'une publication
Il n'y a pas de taxe pour le dépôt d'une souche bactérienne à la CIP, sauf pour celles dont la distribution est protégée par un materiel transfert agreement (MTA)..
La CIP se réserve le droit d'accepter ou de refuser le dépôt d'une souche.
Les souches bactériennes classées dans le groupe de pathogénicité 3, les souches anaérobies strictes ainsi que les souches nécessitant des conditions de culture non usuelles ne sont pas acceptées par la CIP.

Toute demande de dépôt d'une souche bactérienne à la CIP doit être formulée par écrit en joignant la publication devant être soumise ou les résultats de la caractérisation phénotypique et moléculaire de la souche afin que la CIP puisse réaliser les contrôles nécessaires permettant de délivrer le numéro d'enregistrement de la souche à la CIP et son certificat de contrôle dans les meilleurs délais. La CIP s'engage à ne pas divulguer les renseignements fournis avant que l'article ne soit publié.

Plasmides et transposons

Dépôt

Le dépôt d'un plasmide ou d'un transposon s'accompagne du formulaire de dépôt de plasmides ou transposons dûment rempli en indiquant les conditions de culture.

Dépôt en vue d'une publication
Il n'y a pas de taxe pour le dépôt d'un plasmide ou d'un transposon à la CIP. La CIP se réserve le droit d'accepter ou de refuser le dépôt d'un plasmide ou d'un transposon. Toute demande de dépôt d'un plasmide ou d'un transposon à la CIP doit être formulée par écrit en joignant la publication afin que la CIP puisse réaliser les contrôles.

Les plasmides et les transposons sont conservés dans une bactérie hôte. Les souches sont congelées et contrôlées pour leur viabilité et leur pureté ainsi que pour la présence des marqueurs chromosomiques et plasmidiques avant délivrance.

Toute demande de plasmides ou de transposons doit être adressée par écrit (courrier ou fax) à la CIP.
La distribution de certains plasmides est restreinte. Il est nécessaire de prendre contact avec la CIP pour en obtenir la liste et les commander.

Les souches sont délivrées soit congelées soit repiquées. Après reception, la mise en culture de la souche se fait sur un milieu non selectif ainsi que sur un milieu selectif approprié.

Pour vos commentaires sur cette rubrique et vos questions, écrire à CIP@pasteur.fr